Clinical evaluation of a new molecular method for the detection of multidrug-resistant microorganisms
Por:
de la Rica-Martínez A, Andres-Franch M, Estan-Cerezo G, Ruiz-Garcia M, Rodríguez-Díaz JC, Gonzalo-Jimenez N and Galiana A
Publicada:
1 ago 2022
Ahead of Print:
1 ago 2022
Resumen:
Introduction: The main objective of this work is to carry out the clinical validation of the trial with the AMR Direct Flow Chip (R) starting from either nasal swabs, rectal swabs directly or from isolated strains to detect antibiotic resistance genes.
Methods: We developed the preclinical validation of the assay with 104 known bacterial isolates. A total of 210 nasal or rectal swab samples were analyzed. The AMR assay is based on multiplex PCR followed by reverse dot blot hybridization on DNA arrays fully automated by using the HS24 platform. The completion time of the full analysis is 3 hours.
Results: Both the sensitivity and specificity of the preclinical assay were 100%, with the 104 samples correctly identified. In the clinical validation, the sensitivity was 100% and the specificity was between 100% in rectal swabs and 97% in nasal swabs.
Conclusions: The AMR Direct Flow Chip (R) is a rapid and effective assay for the detection of multidrug-resistant microorganisms from nasal and rectal swab samples. (C) 2021 Sociedad Espanola de Enfermedades Infecciosas y Microbiologia Clinica. Published by Elsevier Espana, S.L.U. All rights reserved.
Filiaciones:
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Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
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Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
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Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
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Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
Rodríguez-Díaz JC:
Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Alicante, Instituto de Investigación Sanitaria y Biomédica de Alicante (ISABIAL), Alicante, España
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Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
Galiana A:
Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
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